Wo soll das Problem sein? Es gibt keinerlei Vorschriften darüber wie bei der Buchhaltung die Dokumente abgelegt werden müssen, es muss lediglich so sein daß sich ein fachkundiger Dritter in kurzer Zeit einarbeiten kann. Wenn dann die Rechnungen numeriert abgeheftet sind, dann kann jedes Dokument in kürzester Zeit gefunden werden.Es dürfte auch Probleme geben, dem Finanzamt die Unterlagen zwecks Prüfung zur Verfügung zu stellen.
Letztendlich ist es für das Finanzamt sogar einfacher. Wenn ich z.B. alle Rechnungen eines Lieferanten der letzten drei Jahre möchte, dann geb ich in EloOffice einfach den Namen ein und hab alle Rechnungen innerhalb von 2 Sekunden. Selbst wenn ich z.B. von einem Kontoauszug nur einen Betrag hab, dann gebe ich den Betrag ein und finde die Rechnung.